MRワゴンは前後のドアとも乗降性に優れている。特に小さな子供が一人で乗り降りするリヤドアは、ドアが直角に近いくらいまで大きく開くほか、子供が足をかけるサイドステップの部分が大きく作られていて、頭をぶつけることがないように、リヤドア開口部の上部にも大きな余裕を持たせている。
運転席に乗り込むと、インテリア回りのデザインも可愛らしさを強調した女性向けのものに仕上げられている。丸というか楕円をモチーフにしたインパネのデザインは、明るい色調や表面にメタル調の塗装を施したオーディオ&エアコンのパネルなどによって、質感を感じさせるものになった。
快適装備は上級グレードのGやTには、カテキンエアフィルター付きのフルオートエアコンやオーディオ、キーレススタートシステムなど、軽自動車としては充実した装備が用意されている。ただ、廉価グレードのGではABSがオーディオ設定になっており、これは全車標準にして欲しいところ。運転席助手席のSRSエアバッグは全車に標準だ。